Окончил Петербургский горный институт (1896). Член-корреспондент (с 1923) и действительный член (с 1929) АН СССР. Основатель Института, директор (1930-1944), зав. отделом (1930-1931 и 1934-1937). До этого – сотрудник Геологического комитета, зав. отделом и и.о. директора (1921-1930) Геологического музея АН СССР, зав. кафедрой Горного института. Был также зав. кафедрой палеонтологии геолого-почвенного факультета МГУ (1939-1942), зам. академика-секретаря Отделения биологических наук АН СССР (1939-1944). Член-учредитель Русского палеонтологического общества (1916), почетный член ВПО (с 1936). Государственная премия (1943). Двустворчатые моллюски, преимущественно юры, другие беспозвоночные мезозоя и кайнозоя, млекопитающие кайнозоя; региональная геология, общие вопросы палеонтологии, история науки. Около 270 публикаций, в том числе 31 монография. Списки работ и др. данные о нем см.: «Алексей Алексеевич Борисяк (1872-1944)» (Мат-лы к библиографии ученых СССР. Сер. биол. н. Палеонтология. Вып.1. 1947, М.-Л.: Изд-во АН СССР). «Памяти академика А.А. Борисяка» (1949, Тр.ПИН, Т.25). «Палеонтологический институт Академии наук СССР. 1930-1980» (1980, М.: Наука).